Detailsema info iga analüüsi hinna, proovimaterjali säilivuse ja transpordi tingimuste kohta leiab koondtabelist.
- Aeroobne külv
- Anaeroobne külv
- Anaplasma phagocytophilum IgG, IgM (S-A phagocytoph IgG, S-A phagocytoph IgM)
- Anaplasma phagocytophilum/Ehrlichia canis DNA (B-Anapl/Ehrlich DNA)
- Bakteriaalse vaginoosi ja trihhomoniaasi DNA paneel
- Bakteriaalse vaginoosi ja vaginiidi tekitajate DNA paneel
- Bartonella henselae DNA
- Bartonella henselae IgG, IgM paneel (S-B henselae Ab panel)
- Bartonella henselae/quintana IgG, IgM paneel (S-B Bartonella Ab panel)
- Beetahemolüütilise streptokoki külv
- Bordetella pertussis diagnostika
- Borrelia burgdorferi DNA
- Borrelia burgdorferi IgG, IgM (kinnitav) (S-B burgd IgG conf, S-B burgd IgM conf)
- Borrelia burgdorferi IgG, IgM (S-B burgdorferi IgG, IgM, S-B burgdorferi IgM)
- Borrelia burgdorferi IgG, IgM liikvoris (CSF-B burgd IgG, CSF-B burgd IgM)
- Brucella IgG, IgM (S-Brucella IgG, IgM panel)
- Brucella DNA (B-Brucella DNA)
- Campylobacter IgA, IgG, IgM (S-Campylo IgA, S-Campylo IgG, S-Campylo IgM)
- Campylobacter spp. külv
- Chlamydia psittaci DNA
- Chlamydia psittaci IgA, IgG, IgM (S-C psittaci IgA, S-C psittaci IgG, S-C psittaci IgM)
- Chlamydia trachomatis DNA (sh LGV)
- Chlamydia trachomatis IgA, IgG (S-C trachomatis IgA, S-C trachomatis IgG)
- Chlamydia trachomatis LGV DNA
- Chlamydophila pneumoniae IgA, IgG, IgM (S-C pneum IgA, S-C pneum IgG, S-C pneum IgM)
- Chlamydophila pneumoniae, Mycoplasma pneumoniae DNA paneel
- Clostridioides difficile toksiinid A, B roojas (St-C difficile A, B)
- Clostridium tetani toksiini IgG (S-C tetan IgG)
- Corynebacterium diphtheriae toksiini antikehad (S-C diphtheriae Ab)
- Coxiella burnetii DNA (B-C burnetii DNA)
- Coxiella burnetii faas 2 IgG, IgM (S-C burnetii ph2 IgG, S-C burnetii ph2 IgM)
- ESBL produtseerivate enterobakterite külv
- Francisella tularensis IgG, IgM (S-F tularensis IgG, S-F tularensis IgM)
- Haemophilus influenzae B IgG (S-H infl B IgG)
- Helicobacter pylori antigeen roojas (St-H pylori Ag)
- Helicobacter pylori DNA, klaritromütsiin- ja flourokinoloonide-tundlikkuse paneel (Bx-H pylori gen panel)
- Helicobacter pylori IgA (S-H pylori IgA)
- Helicobacter pylori IgG (S-H pylori IgG)
- Leptospira IgG, IgM (S-Leptospira IgG, S-Leptospira IgM)
- Meningiiditekitajate bakterite DNA paneel liikvoris (CSF-MenBac DNA panel)
- MRSA külv
- Mycoplasma genitalium DNA
- Mycoplasma hominis, Ureaplasma sp DNA paneel
- Mycoplasma pneumoniae IgA, IgG, IgM (S-M pneum IgA, S-M pneum IgG, S-M pneum IgM)
- Neisseria gonorrhoeae DNA
- Neisseria gonorrhoeae külv
- NK-rakkude (CD57) paneel (B-CD3-,CD57+)
- Rickettsia conorii/typhi IgG, IgM paneel (S-Rickettsia panel)
- Salmonella spp. külv
- Shigella spp. külv
- Soolebakterite DNA paneel (EntericBac DNA panel)
- Soolepatogeenide (Salmonella, Shigella, Campylobacter) külv
- Süüfilise diagnostika
- Trichomonas vaginalis DNA
- Yersinia spp. külv
- A-hepatiidi viiruse antikehad (S-HAV Ab)
- A-hepatiidi viiruse IgM (S-HAV IgM)
- A-hepatiidi viiruse RNA roojas (St-HAV RNA)
- B-hepatiidi diagnostika
- B-hepatiidi viiruse DNA (HBV DNA)
- B-hepatiidi viiruse DNA (kvalitatiivne) (HBV DNA QN)
- B-hepatiidi viiruse genotüüp (B-HBV genot)
- B-hepatiidi viiruse pinnaantigeen (S-HBsAg)
- B-hepatiidi viiruse pinnaantigeeni antikehad (S-HBs Ab)
- B-hepatiidi viiruse tuuma antigeeni antikehad (S-HBc Ab)
- B-hepatiidi viiruse tuuma antigeeni IgM (S-HBc IgM)
- B-hepatiidi viiruse ümbrise antigeen (S-HBeAg)
- B-hepatiidi viiruse ümbrise antigeeni antikehad (S-HBe Ab)
- B-hepatiidi markerite tõlgendamine
- C-hepatiidi diagnostika
- C-hepatiidi viiruse antikehad (immunoblot) (S-HCV Ab IB)
- C-hepatiidi viiruse antikehad (S-HCV Ab)
- C-hepatiidi viiruse genotüüp (S-HCV genot)
- C-hepatiidi viiruse RNA (HCV RNA)
- C-hepatiidi viiruse RNA (kvalitatiivne) (P-HCV RNA QN)
- D-hepatiidi viiruse antikehad (S-HDV Ab)
- D-hepatiidi viiruse RNA (kvalitatiivne) (P-HDV RNA QN)
- E-hepatiidi viiruse IgG, IgM (immunoblot) (S-HEV IgG IB, S-HEV IgM IB)
- E-hepatiidi viiruse IgG (S-HEV IgG, S-HEV IgM)
- E-hepatiidi viiruse RNA (HEV RNA)
- G-hepatiidi viiruse RNA (P-HGV RNA)
- A (H1N1)-gripi viiruse RNA
- A- ja B-gripi viiruse RNA paneel (POCT)
- A-, B-gripi viiruse ja RSV RNA paneel
- A-, B-gripi viiruse, RSV, SARS-CoV-2 RNA paneel
- A-gripi viiruse IgA, IgG (S-Infl A IgA, S-Infl A IgG)
- B-gripi viiruse IgA, IgG (S-Infl B IgA, S-Infl B IgG)
- Aeroobne külv (röga, trahheaaspiraat, bronhiaspiraat)
- Bordetella pertussis diagnostika
- Chlamydia psittaci DNA
- Chlamydia psittaci IgA, IgG (S-C psittaci IgA, S-C psittaci IgG)
- Chlamydophila pneumoniae IgA, IgG, IgM (S-C pneum IgA, S-C pneum IgG, S-C pneum IgM)
- Chlamydophila pneumoniae, Mycoplasma pneumoniae DNA paneel
- Coxiella burnetii DNA (B-C burnetii DNA)
- Coxiella burnetii faas 2 IgG, IgM (S-C burnetii ph2 IgG, S-C burnetii ph2 IgM)
- Mycoplasma pneumoniae IgA, IgG, IgM (S-M pneum IgA, S-M pneum IgG, S-M pneum IgM)
- SARS koroonaviirus 2 IgG (kvantitatiivne) (S-SARS-CoV-2 IgG QN)
- SARS koroonaviirus 2 RNA (SARS-CoV-2 RNA)
- Clostridium tetani toksiini IgG (S-C tetan IgG)
- Corynebacterium diphtheriae toksiini antikehad (S-C diphtheriae Ab)
- Haemophilus influenzae B IgG (S-H infl B IgG)
- Meningokoki IgG paneel (immuunsuse kontroll) (S-Mening IMC panel)
- Acanthamoeba spp DNA
- Aeroobne külv (keskõrv, väliskõrv, ninaneel, silm)
- Beetahemolüütilise streptokoki külv
- Samastamine MALDI-TOF meetodil
- Vankomütsiin-resistentsus VanA ja VanB geenide alusel (Is-VRE)
- Nahaseente DNA paneel
- Nahaseente külv
- Nahaseente mikroskoopia
- Tuulerõugeviiruse IgG, IgM (S-VZV IgG, S-VZV IgM)
Näidustus: Kahtlus alumiste hingamisteede bakteriaalsele infektsioonile
Analüüsimeetodid: Algmaterjali mikroskoopia, aeroobne külv söötmetele, haigustekitaja samastamine ja ravimtundlikkuse määramine
Tõlgendus: Bronhiaspiraadi mikroskoopial hinnatakse polümorfonukleaarsete leukotsüütide hulka vaateväljas (üksikud, mõõdukalt või rohkesti) ja bakterite morfoloogiat. Alumiste hingamisteede bakteriaalset infektsiooni põhjustavad Streptococcus pneumoniae, Haemophilus influenzae, Moraxella catarrhalis, Staphylococcus aureus, Pseudomonas spp, enterobakterid. Külvis loetakse tähenduslikuks alati selliste bakterite leid nagu Streptococcus pyogenes, MRSA, Pseudomonas spp. Hospitaalinfektsioonide tekkes mängivad olulist rolli enterobakterid, Acinetobacter spp., Pseudomonas spp., Stenotrophomonas spp., Burkholderia cepacia. Valenegatiivse külvitulemuse põhjuseks võivad olla materjali ebaõiged säilitustingimused või alustatud antibiootikumravi. Valepositiivne külvitulemus võib esineda materjali kontamineerumisel ülemistest hingamisteedest või proovikonteineri lekkimisest.
- Aeroobne külv
- Mikroskoopia Leishman-Giemsa ja Gram paneel
- Neisseria gonorrhoeae külv
Paljud mikroobid, mis koloniseerivad nahka ja limaskesti, võivad põhjustada ka naha- ja pehmete kudede infektsioone. Ägedad nahainfektsioonid tekivad sageli operatsiooni- või traumajärgselt. Kroonilised infektsioonid tekivad lamatistest, kroonilisest verevarustuse puudulikkusest või ainevahetuse häiretest. Erinevad haavad koloniseeruvad erinevate mikroobidega ja mikrobioloogiline külv on näidustatud ainult siis, kui haavas esinevad põletikutunnused (punetus, turse, valu, temperatuuri tõus, eritis) või kui haav paraneb halvasti. Parimaks materjaliks on koetükk või aspiraat, halvemaks loetakse tampooniga võetud materjali. Sagedasemateks haavainfektsiooni tekitajateks on Staphylococcus aureus, Streptococcus pyogenes, Pseudomonas aeruginosa, enterobakterid ja anaeroobid. Põletushaavadest tuleb materjali võtta erinevatest kohtadest, sest bakterid koloniseerivad pinda ebaühtlaselt.
Kliiniline leid
|
Sagedasemad tekitajad
|
Kommentaar
|
Pindmised infektsioonid:
Erüsiipelas, tselluliit, tsüst, karbunkel,
follikuliit, haavad, nahaalune abstsess, abrasioon, I astme põletushaavad
|
S. aureus sh MRSA
A-, B-, C-, G-grupi
streptokokid KONS Peptostreptococcus
Corynebacterium spp.
Herpes simplex
|
HSV – võimalik määrata PCR
meetodil |
Sügavad haavainfektsioonid:
Looma hammustus
|
Pasteurella multocida
Capnocytophaga spp.
Eikenella corrodens
|
Aeromonas
spp., Vibrio spp., Capnocytophaga violaceum
võib esineda haavades, mis on kokku puutunud väliskeskkonna veega
|
Sügavad haavainfektsioonid:
Inimese hammustus
II, III astme põletushaavad
Kirurgilised haavad
Lamatishaavandid
Troofilised haavandid
|
Aeroobsed ja fakultatiivsed anaeroobsed bakterid, võivad esineda ka anaeroobsed bakterid |
|
Abstsess, dreenieritis, koetükk
|
Aeroobsete ja fakultatiivselt anaeroobsete bakterite segainfektsioon, võivad esineda ka anaeroobsed bakterid
|
Mikroskoopia võib viidata anaeroobsele infektsioonile
|
Näidustus: Kahtlus ägedale või kroonilisele haavainfektsioonile, halvasti paranev haav
Uuritav materjal: Haavaeritis, mäda, haavandieritis, troofilise haavandi eritis, abstsessimaterjal
Analüüsimeetodid: Algmaterjali mikroskoopia, aeroobne külv söötmetele, haigustekitaja samastamine ja ravimtundlikkuse määramine
Tõlgendus:
- Mikroskoopial viitab polümorfonukleaarsete leukotsüütide rohkus põletikulisele ja infektsioossele protsessile, samuti hinnatakse bakterite morfoloogiat ja anaeroobse infektsiooni võimalikkust. Kui patsiendil esineb immuunpuudulikkus või verevarustuse häire, siis põletikulist reaktsiooni ei saa preparaadis hinnata, kuna infektsiooni olemasolul ei pruugi preparaadis leukotsüüte esined
- NB! Paljud haavainfektsioonid on polümikroobsed ja bakterite esinemine võib tähendada nii infektsiooni kui kolonisatsiooni. Seega labori poolt väljastatud vastus ei ole lõplik ja ravi vajalikkuse üle saab otsustada arvestades kogu kliinilist informatsiooni, preparaadi leidu ja isoleeritud haigustekitajat.
- Nahaseente külv
- Beetahemolüütilise streptokoki külv
- MRSA külv
- Neisseria gonorrhoeae külv
80% lastest on kuuendaks eluaastaks põdenud kõrvapõletikku. Diagnoos püstitatakse enamasti kliinilise pildi järgi ja eristatakse välis- ja keskkõrvapõletikku. Väliskõrva mikrofloora sarnaneb nahamikroflooraga, peamiselt esinevad stafülokokid ja korüneformsed bakterid. Sagedasemateks väliskõrvapõletiku tekitajateks on Staphylococcus aureus, Streptococcus pyogenes, Pseudomonas aeruginosa (nn ujujate kõrv) ja Aspergillus spp.. Sagedasemad keskkõrvapõletiku tekitajad on Staphylococcus aureus, Streptococcus pneumoniae, Streptococcus pyogenes, Haemophilus influenzae, Moraxella catarrhalis, Pseudomonas aeruginosa ja viirused nagu RS viirus, Influenza viirus, Enteroviirus või Rhinoviirus. Kroonilise mädase otiidi puhul võivad tekitajateks olla ka Staphylococcus epidermidis, Corynebacterium spp., Candida spp., Bacteroides spp., Nocardia spp. ja Peptostreptococcus spp.. Võib esineda ka viirus-bakter segainfektsiooni, mille puhul sümptomite kestus pikeneb. <6 kuu vanuste laste keskõrvapõletiku tekitajaks võib olla ka Chlamydia trachomatis.
Näidustus: Välis-või keskkõrvapõletik
Uuritav materjal: Väliskõrvaeritis, keskkõrvaeritis (sh paratsenteesil saadud punktaat)
Analüüsimeetodid: Algmaterjali mikroskoopia, aeroobne külv söötmetele, haigustekitaja samastamine ja ravimtundlikkuse määramine
Tõlgendus: Negatiivne külvitulemus ei välista keskkõrvainfektsiooni, krooniliste infektsioonide puhul jääb bakter sageli isoleerimata. Valenegatiivne tulemus võib esineda normaalse mikrofloora ülekasvu korral. Tavaliselt loetakse koagulaasnegatiivsed stafülokokid ja korüneformsed bakterid normaalseks mikroflooraks, välja arvatud juhtudel, kui nende kasv on suures hulgas ja monokultuurina.
- Nahaseente külv
- Mikrobioloogiline uuring
- MRSA külv
- Aeroobne külv
- MRSA külv
- Nahaseente külv
Näidustus:Kahtlus bakteriaalsele infektsioonile
Uuritav materjal: Pleuravedelik, liigesevedelik, kõhuõõnevedelik, perikardivedelik, amnionivedelik
Analüüsimeetodid: Algmaterjali mikroskoopia, aeroobne külv söötmetele, haigustekitaja samastamine, ravimtundlikkuse määramine
Tõlgendus: Igasugune mikroobide leid normaalselt steriilses kehavedelikus on diagnostiliselt oluline. Proov võib olla kontamineerunud naha mikrofloorasse kuuluvate bakteritega ja seetõttu saab ravi vajalikkuse üle otsustada arvestades kliinilist leidu ja põletikunäitjaid veres. Sagedasemateks liigeseinfektsiooni tekitajateks on Staphylococcus aureus ja Streptococcus pyogenes. Peritoneaalvedelikus on sagedasemateks haigustekitajateks Staphylococcus spp., Streptococcus spp., Gram-negatiivsed bakterid ja Candida spp.
Rinnanäärme põletik esineb 5-33%-l rinnaga toitvatel emadel. Infektsioon tekib sagedamini 2.-3. sünnitusjärgsel nädalal, mil piima eritus näärmest on intensiivne ja võib tekkida piimastaas. Mastiit võib olla erineva raskusastmega: erütematoossest laigust abstsessini. Sageli kaasnevad palavik, külmavärinad ja lümfadenopaatia. Rinnapiim iseenesest ei ole steriilne, vaid sisaldab naha mikrofloorasse kuuluvaid baktereid. Seega on mõnikord raske vahet teha, kas tegemist on lihtsalt piimastaasiga või juba bakteriaalse infektsiooniga.
Näidustus: Kahtlus bakteriaalsele rinnanäärme põletikule
Uuritav materjal: Rinnapiim
Analüüsimeetodid: Aeroobne külv söötmetele, haigustekitaja samastamine ja ravimtundlikkuse määramine
Tõlgendus: Kõige sagedasem mastiidi tekitaja on Staphylococcus aureus, tekitajateks võivad olla ka Staphylococcus epidermidis, Streptococcus spp., Enterococcus spp. ja enterobakterid.
- Campylobacter spp. külv
- Neisseria gonorrhoeae külv
- Salmonella spp. külv
- Shigella spp. külv
- Soolepatogeenide (Salmonella, Shigella, Campylobacter) külv
- Yersinia spp. külv
- Campylobacter spp. külv
- Clostridioides difficile toksiinid A, B roojas
- ESBL produtseerivate enterobakterite külv
- Salmonella spp. külv
- Shigella spp. külv
- Soolepatogeenide (Salmonella, Shigella, Campylobacter) külv
- Ussnugiliste munad ja algloomade tsüstid
- Yersinia spp. külv
Röga mikrobioloogiline uurimine on oluline alumiste hingamisteede infektsioonide diagnoosimisel. Kui röga pole proovimaterjalina kättesaadav, võib raviotsuse tegemisel lähtuda patsiendi east, esinevatest riskifaktoritest ja sagedasematest haigustekitajatest. Kopsupõletikud jaotatakse kodu- ja haiglatekkesteks ning kliinilise pildi alusel tüüpilisteks ja atüüpilisteks.
Vanus, riskifaktorid
|
Sagedasemad tekitajad
|
<6 nädalat
|
Streptococcus agalactiae
Escherichia coli
|
6 nädalat – 18 a
|
Respiratoorsed viirused (sh RSV)
Mycoplasma pneumoniae
Chlamydophila pneumoniae
Streptococcus pneumoniae
|
Täiskasvanud <65 a
|
Mycoplasma pneumoniae
Chlamydophila pneumoniae
Streptococcus pneumoniae
Respiratoorsed viirused
|
Täiskasvanud ≥65 a
|
Streptococcus pneumoniae
Haemophilus influenzae
Gram-negatiivsed
pulkbakterid Respiratoorsed viirused
Pseudomonas spp.
Moraxella catarrhalis
Staphylococcus aureus
Legionella pneumophila
|
Haiglatekkene pneumoonia
|
Gram-negatiivne pulkbakter
Klebsiella pneumoniae
Pseudomonas spp.
Staphylococcus aureus
|
Immuunpuudulikkusega
patsient |
Gram-negatiivne pulkbakter
Streptococcus pneumoniae
Seened
Nocardia spp.
Pneumocystis jirovici
|
Aspiratsioon
|
Anaeroobid
|
Alkohoolik
|
Klebsiella pneumoniae
Streptococcus pneumoniae
Anaeroobid
|
Intravenoosne süstija
|
Staphylococcus aureus
|
Viirusinfektsiooni
järgselt |
Staphylococcus aureus
|
Streptococcus pneumoniae on keskkonnatekkese kopsupõletiku sagedaseim tekitaja. Staphylococcus aureus on sagedaseim viirusinfektsioonijärgse kopsupõletiku tekitaja (eriti vanuritel). Atüüpiliste pneumooniate sagedasemateks tekitajateks on Mycoplasma pneumoniae, Chlamydophila pneumoniae ja Legionella pneumophila. Legionella pneumophila võib esineda nii tervetel kui immuunkomprimeeritutel ja infektsioon on sageli raske kuluga.
Näidustus: Alumiste hingamisteede bakteriaalne infektsioon
Analüüsimeetodid: Algmaterjali mikroskoopia, aeroobne külv söötmetele, haigustekitaja samastamine ja ravimtundlikkuse määramine
Tõlgendus: Röga on soovitav materjal alumiste hingamisteede bakteriaalsete infektsioonide diagnoosimiseks, kuid tuleb arvestada, et sageli on see kontamineerunud materjaliga ülemistest hingamisteedest ning et paljud tekitajad ei kasva tavasöötmetel (Legionella, Chlamydophila, Mycoplasma).
Alumiste hingamisteede materjalidest tehakse laboris esmalt Grami järgi värvitud preparaat. Kui preparaadis esineb >10 lameepiteeliraku ja <10 polümorfonukleaarse leukotsüüdi, siis käsitletakse materjali kui sülge ja mikrobioloogilist külvi ei teostata. Kuna vastsündinutel, imikutel ja väikelastel pole võimalik saada röga väljaköhimise teel, aspireeritakse neil materjali ülemistest hingamisteedest. Rögast anaeroobseid baktereid ei määrata, kuna materjal on kontamineerunud ülemiste hingamisteede normaalsesse mikrofloorasse kuuluvate anaeroobidega. Patogeensete mikroobide kasvu puudumine külvis ei tähenda alati infektsiooni puudumist. Põhjuseks võivad olla alustatud ravi antibiootikumidega ning teised tekitajad – viirused, seened, parasiidid, mükobakterid või mükoplasmad. Alumiste hingamisteede infektsioonide puhul jääb tekitaja leidmata 40 – 60%-l juhtudest.
Silm on tundlik ja infektsioonidele avatud piirkond. Silmaeritise mikrobioloogilise uuringu eripäraks on, et materjali on tavaliselt vähe, uut materjali võtta on raske ja silma igal struktuuril esineb oma infektsioon, mis võib lõppeda jääva kahjustusega. Sagedasemad silmainfektsioonid on laupõletik e blefariit, sidekestapõletik e konjunktiviit, sarvkestapõletik e keratiit ja silmasisemusepõletik e endoftalmiit. Silmalaug ja -sidekest on kaetud normaalse naha- ja näärmete mikroflooraga, kuhu kuuluvad koagulaasnegatiivsed stafülokokid (KONS), viridans grupi streptokokid, korünebakterid ja propioonibakterid.
Diagnoos
|
Sagedasemad tekitajad
|
Kommentaar
|
Blefariit
|
Koagulaasnegatiivsed
stafülokokid (KONS) Staphylococcus
aureus Gram-negatiivsed pulkbakterid
|
*Ravi on empiiriline, mikrobioloogilist külvi
sageli ei teostata *Põhjuseks võib olla ka rasunäärmete
düsfunktsioon nö kuiv silm |
Bakteriaalne konjunktiviit
Viraalne konjunktiviit
|
Staphylococcus aureus
Streptococcus
pyogenes Streptococcus
pneumoniae Haemophilus
influenzae Moraxella
spp. Neisseria
gonorrhoeae Adenoviirus
Enteroviirus
|
*Vastsündinutel on oluline
määrata Chlamydia trachomatis ja Neisseria gonorrhoeae – PCR meetodil *Konjunktiviit võib olla põhjustatud ka allergiast või ärritusest
|
Bakteriaalne keratiit
Viiruslik keratiit
Seenkeratiit
|
Pseudomonas
spp. Staphylococcus
aureus KONS
Streptococcus
pneumoniae Moraxella
spp. Viridans grupi streptokokid
Mycobacterium
spp. Nocardia
spp. Herpes
simplex viirus Herpes
zoster viirus Aspergillus
spp. Fusarium
spp. Alternaria
spp. Penicillum
spp. |
*Krooniliste infektsioonide puhul välistada Nocardia spp., Mycobacterium spp. ja seened
*Pseudomonas
spp. infektsioon võib põhjustada sarvkesta perforatsiooni <48h jooksul
*Sarvkesta haavandite ja trigeminaalneuralgia
puhul mõelda viirustele *Acanthamoeba spp. infektsioonile mõelda, kui silma
on sattunud saastunud vett, pinnase-, taimede- või puuosakesi *Keratiit võib tekkida ka keemilise põletuse,
operatsiooni või allergia järgselt *50%-l juhtudest jääb mikrobioloogiline külv
negatiivseks |
Parasitaarne keratiit
Kontaktläätse keratiit
|
Acanthamoeba
spp. Acanthamoeba
spp. Serratia
spp. Bacillus
spp. |
|
Bakteriaalne endoftalmiit
Viiruslik endoftalmiit
Seen- endoftalmiit
Parasitaarne endoftalmiit
|
Staphylococcus
aureus/MRSA Viridans grupi streptokokid
Bacillus
spp. Pseudomonas
spp. Gram-negatiivsed pulkbakterid
Propionibacterium
acnes Anaeroobid
Tsütomegaloviirus
Leetriviirus
Candida
spp. Aspergillus
spp. Cryptococcus
spp. Toxoplasma
gondii |
*Endoftalmiit võib tekkida baktereemia järgselt,
hematogeensel teel, postkeratoplastiliselt või trauma järgselt *Külviks sobib silmasisene vedelik või -kude
|
Uuritav materjal: Silmamaterjal, konjunktiivikaabe, pisaravedelik
Analüüsimeetodid: Algmaterjali mikroskoopia, aeroobne külv söötmetele, haigustekitaja samastamine ja ravimtundlikkuse määramine
Tõlgendus: Bakteriaalse infektsiooni puhul esinevad preparaadis enamasti polümorfonukleaarsed leukotsüüdid, allergiliste haiguste puhul pigem eosinofiilid ja viiruslike infektsioonide puhul nii mono- kui lümfotsüüdid. Sagedasemateks bakteriaalse silmapõletiku tekitajateks on Staphylococcus aureus, Streptococcus pyogenes, Streptococcus pneumoniae, Haemophilus influenzae ja Moraxella spp. Vastsündinutel võivad konjunktiviidi tekitajateks olla ka Chlamydia trachomatis ja Neisseria gonorrhoeae. Hospitaliseeritud- ja langenud immuunsusega patsientidel põhjustavad konjunktiviiti tavaliselt Pseudomonas spp. ja enterobakterid.
Urogenitaaltrakti materjalide mikrobioloogiline uuring meestel on näidustatud uretriidi, balaniidi, epididümiidi, prostatiidi või genitaalhaavandite puhul. Mehe ureetras leidub suhteliselt vähe naha mikrofloorasse kuuluvaid baktereid: koagulaasnegatiivsed stafülokokid (KONS), korüneformsed bakterid, α-hemolüütiline streptokokk ja mikrokokid. Sagedasemad uretriidi tekitajad on Chlamydia trachomatis, Neisseria gonorrhoeae, Trichomonas vaginalis ja mükoplasmad, mis tavakülvis välja ei kasva ja spetsiaalset mikrobioloogilist külvi neile laboris ei teostata. Diagnoosimiseks on võimalik teostada PCR uuring.
Näidustus: Urogenitaaltrakti infektsioonid, sperma steriilsuse kontroll
Analüüsimeetodid: Aeroobne külv söötmetele, haigustekitaja samastamine, ravimtundlikkuse määramine
Tõlgendus: Bakteriaalse uretriidi tekitajateks võivad olla Candida spp., Streptococcus agalactiae, Streptococcus pyogenes, Staphylococcus aureus, Haemophilus influenzae, Oligella urethralis, enterobakterid. 20 – 40%-l juhtudest jääb tekitaja kindlaks tegemata. Põletiku esinemise üle saab otsustada mikroskoopilise leiu alusel.
Näidustus: Kahtlus alumiste hingamisteede bakteriaalsele infektsioonile, kolonisatsiooni jälgimine intubeeritud patsientidel
Analüüsimeetodid: Algmaterjali mikroskoopia, aeroobne külv söötmetele, haigustekitaja samastamine ja ravimtundlikkuse määramine
Tõlgendus:
Mikroskoopial hinnatakse polümorfonukleaarsete leukotsüütide hulka vaateväljas (üksikud, mõõdukalt või rohkesti) ja bakterite morfoloogiat. Sagedasemad alumiste hingamisteede infektsiooni tekitajad on Streptococcus pneumoniae, Haemophilus influenzae, Klebsiella spp., Pseudomonas aeruginosa, Staphylococcus aureus.
Intubeeritud patsiendil võib bakterite leid tähendada nii infektsiooni kui kolonisatsiooni. Seega pole labori poolt väljastatud vastus lõplik ja ravi vajalikkuse üle otsustamisel peab arvestama kogu kliinilist informatsiooni, mikroskoopia leidu ja isoleeritud haigustekitajat.
- Beetahemolüütilise streptokoki külv
- Aeroobne külv
- Mikroskoopia Leishman-Giemsa ja Gram paneel
- Neisseria gonorrhoeae külv
- Aeroobne külv
- Mikroskoopia Leishman-Giemsa ja Gram paneel
- Neisseria gonorrhoeae külv
- Acanthamoeba spp DNA
- Anisakise IgG (S-Anisakis IgG)
- Ascarise (täiskasvanud) IgG (S-Ascaris IgG)
- Babesia DNA (B-Babesia DNA)
- Babesia microti IgG, IgM (S-B microti IgG, IgM panel)
- Babesia divergens IgG (S-Babesia IgG panel)
- Echinococcus DNA
- Echinococcus granulosus IgG (immunoblot) (S-E granul IgG IB)
- Echinococcus granulosus IgG (S-E granul IgG)
- Echinococcus granulosus IgG liikvoris (CSF-E granul IgG)
- Echinococcus multilocularis IgG (immunoblot) (S-E multiloc IgG IB)
- Echinococcus multilocularis IgG (S-E multiloc IgG)
- Echinococcus multilocularis IgG liikvoris (CSF-E multiloc IgG)
- Echinococcuse antikehad (S-Echinoc Ab)
- Entamoeba histolytica DNA
- Entamoeba histolytica IgG (S-E histolytica IgG)
- Enterobius vermicularis munade mikroskoopia (An-E vermicularis-m)
- Fasciola hepatica antikehad (S-F hepatica Ab)
- Filaria antikehad (S -Filaria Ab)
- Nematoodide IgG (Anisakis, Ascaris, Filaria, Strongyloides, Toxocara, Trichinella) (immunoblot) (S-Nematodes IgG)
- Sooleparasiitide DNA paneel (St-EntericParasite DNA panel)
- Taenia solium antikehad (S-T solium Ab)
- Taenia solium antikehad (immunoblot) (S-T solium Ab conf)
- Taenia solium antikehad liikvoris (immunoblot) (CSF-T solium Ab)
- Toxoplasma gondii DNA
- Toxoplasma gondii IgG, IgM (S-T gondii IgG, S-T gondii IgM)
- Ussnugiliste munade ja algloomade tsüstid (St-Parasites-m)
- Anaplasma phagocytophilum IgG, IgM (S-A phagocytoph IgG, S-A phagocytoph IgM)
- Anaplasma phagocytophilum/Ehrlichia canis DNA (B-Anapl/Ehrlich DNA)
- Babesia DNA
- Babesia microti IgG, IgM (S-B microti IgG, IgM panel)
- Babesia divergens IgG (S-Babesia IgG panel)
- Bartonella henselae/quintana IgG, IgM paneel (S-B Bartonella Ab panel)
- Borrelia burgdorferi DNA
- Borrelia burgdorferi IgG, IgM (S-B burgdorferi IgG, IgM, S-B burgdorferi IgM)
- Borrelia burgdorferi IgG, IgM (kinnitav) (S-B burgd IgG conf, S-B burgd IgM conf)
- Borrelia burgdorferi IgG, IgM liikvoris (CSF-B burgd IgG, CSF-B burgd IgM)
- Chikungunya viiruse IgG, IgM (S-Chikungunya IgG, S-Chikungunya IgM)
- Dengue viiruse IgG, IgM (S-Dengue IgG, S-Dengue IgM)
- Dengue viiruse RNA (S-Dengue RNA)
- Filaria antikehad (S-Filaria Ab)
- Francisella tularensis IgG, IgM (S-F tularensis IgG, S-F tularensis IgM)
- Jaapani entsefaliidi viiruse antikehad (S-JEV Ab)
- NK-rakkude (CD57) paneel (B-CD3-,CD57+)
- Puukentsefaliidi viiruse IgG, IgM (S-TBEV IgG, S-TBEV IgM)
- Rickettsia conorii/typhi IgG, IgM paneel (S-Rickettsia panel)
- Zika viiruse IgG, IgM paneel (S-Zika panel)
- Zika viiruse RNA
- Ascarise (täiskasvanud) IgG (S-Ascaris IgG)
- Campylobacter spp. külv
- Clostridioides difficile toksiinid A, B roojas (St-C difficile A, B)
- Entamoeba histolytica DNA
- Entamoeba histolytica IgG (S-E histolytica IgG)
- Enterobius vermicularis munade mikroskoopia (An-E vermicularis-m)
- Enteroviiruste RNA (Entero RNA)
- Fasciola hepatica antikehad (S-F hepatica Ab)
- Helicobacter pylori antigeen roojas (St-H pylori Ag)
- Helicobacter pylori DNA, klaritromütsiin- ja flourokinoloonide-tundlikkuse paneel (Bx-H pylori gen panel)
- Helicobacter pylori IgA (S-H pylori IgA)
- Helicobacter pylori IgG (S-H pylori IgG)
- Mikrobioomi uuring
- Salmonella spp. külv
- Shigella spp. külv
- Seedetrakti infektsioonide diagnostika
- Soolepatogeenide (Salmonella, Shigella, Campylobacter) külv
- Taenia solium antikehad (S-T solium Ab)
- Taenia solium antikehad (immunoblot) (S-T solium Ab conf)
- Taenia solium antikehad liikvoris (immunoblot)(CSF-T solium Ab)
- Ussnugiliste munade ja algloomade tsüstid (St-Parasites-m)
- Yersinia spp. külv
- Aspergillus antigeen (galaktomannaan) (S-Aspergillus Ag)
- Candida albicans DNA veres (B-Candida DNA)
- Candida albicans IgA, IgG, IgM (S-Candida IgA, S-Candida IgG, S-Candida IgM)
- Cryptococcus neoformans antigeen (S-C neoformans Ag)
- Histoplasma capsulatum antikehad (S-H capsulatum Ab)
- Nahaseente DNA paneel
- Nahaseente külv
- Nahaseente mikroskoopia
- Bakteriaalse vaginoosi ja trihhomoniaasi DNA paneel
- Bakteriaalse vaginoosi ja vaginiidi tekitajate DNA paneel
- Chlamydia trachomatis DNA (sh LGV)
- Emakakaelavähi sõeluuring (HPV NAT paneel (EKV sõeluuring)) (HPV NAT panel screen)
- HIV Resistentsus (P-HIV Resistentsus)
- HIV1 INI resistentsusmutatsioonid (P-HIV1 INI mut)
- HPV NAT ja vedelikupõhise tsütoloogia paneel (HPV NAT, LBC panel)
- HPV NAT paneel
- HSV1, HSV2, VZV DNA paneel
- Inimese immuunpuudulikkuse viiruse 1. ja 2. tüübi antikehad, p24 antigeen (S-HIV1,2 Ag+Ab)
- Inimese immuunpuudulikkuse viiruse 1. tüübi RNA hulk (P-HIV1 RNA QN)
- Inimese immuunpuudulikkuse viiruse 2. tüübi RNA (kvalitatiivne) (P-HIV2 RNA QN)
- Inimese papilloomiviiruse DNA, kõrge riskiga genotüüp (HPV DNA genot)
- Lihtherpeseviiruse 1. ja 2. tüübi IgG, IgM (S-HSV1,2 IgM, S-HSV1 IgG, S-HSV2 IgG)
- Mycoplasma genitalium DNA
- Mycoplasma hominis, Ureaplasma sp DNA paneel
- Neisseria gonorrhoeae DNA
- Neisseria gonorrhoeae külv
- STLI DNA haavandi paneel (STDI DNA ulcer panel)
- STLI DNA paneel (STDI DNA panel)
- Süüfilise diagnostika
- Trichomonas vaginalis DNA
- A (H1N1)-gripi viiruse RNA (Infl H1N1 RNA)
- A- ja B-gripi viiruse RNA paneel (POCT)
- A-, B-gripi viiruse ja RSV RNA paneel
- A-, B-gripi viiruse, RSV, SARS-CoV-2 RNA paneel
- Adenoviiruse DNA
- Adenoviiruse IgG, IgM (S-Adenovirus IgG, S-Adenovirus IgM)
- A-gripi viiruse IgA (S-Infl A IgA, S-Infl A IgG)
- A-hepatiidi viiruse antikehad (S-HAV Ab)
- A-hepatiidi viiruse vastane IgM (S-HAV IgM)
- A-hepatiidi viiruse RNA roojas (St-HAV RNA)
- B-gripi viiruse IgA
- B-gripi viiruse IgG
- B-hepatiidi diagnostika
- B-hepatiidi viiruse DNA (HBV DNA)
- B-hepatiidi viiruse DNA (kvalitatiivne) (HBV DNA QN)
- B-hepatiidi viiruse genotüüp (B-HBV genot)
- B-hepatiidi viiruse pinnaantigeen (S-HBsAg)
- B-hepatiidi viiruse pinnaantigeeni antikehad (S-HBs Ab)
- B-hepatiidi viiruse tuuma antigeeni antikehad (S-HBc Ab)
- B-hepatiidi viiruse tuuma antigeeni IgM (S-HBc IgM)
- B-hepatiidi viiruse ümbrise antigeen (S-HBeAg)
- B-hepatiidi viiruse ümbrise antigeeni antikehad (S-HBe Ab)
- B hepatiidi markerite tõlgendamine
- C-hepatiidi diagnostika
- C-hepatiidi viiruse antikehad (immunoblot) (S-HCV Ab IB)
- C-hepatiidi viiruse antikehad (S-HCV Ab)
- C-hepatiidi viiruse genotüüp (S-HCV genot)
- C-hepatiidi viiruse RNA (HCV RNA)
- C-hepatiidi viiruse RNA (kvalitatiivne) (P-HCV RNA QN)
- Chikungunya viiruse IgG, IgM (S-Chikungunya IgG, S-Chikungunya IgM)
- Coxsackie viiruse IgG, IgM (S-Coxsackie IgG, S-Coxsackie IgM)
- Dengue viiruse IgG, IgM (S-Dengue IgG, S-Dengue IgM)
- D-hepatiidi viiruse antikehad (S-HDV Ab)
- D-hepatiidi viiruse RNA (kvalitatiivne) (P-HDV RNA QN)
- EBV IgG aviidsus ja immunoblot paneel (S-EBV IgG panel)
- E-hepatiidi viiruse IgG, IgM (immunoblot) (S-HEV IgG IB, S-HEV IgM IB))
- E-hepatiidi viiruse IgG, IgM (S-HEV IgG, S-HEV IgM))
- E-hepatiidi viiruse RNA
- E-hepatiidi viiruse RNA (HEV RNA)
- Emakakaelavähi sõeluuring (HPV NAT paneel (EKV sõeluuring)) (HPV NAT panel screen)
- Enteroviiruste IgG (S-Entero IgG, S-Entero IgM)
- Enteroviiruste RNA (Entero RNA)
- Epstein-Barr viiruse DNA
- Epstein-Barr viiruse EA IgG
- Epstein-Barr viiruse IgG, IgM (S-EBV VCA IgG, S-EBV VCA IgM, S-EBV NA IgG)
- G-hepatiidi viiruse RNA (P-HGV RNA)
- Hantaviiruste IgG, IgM (immunoblot) (S-Hanta IgG IB, S-Hanta IgM IB))
- Hantaviiruste IgG, IgM(S-Hanta IgG, S-Hanta IgM)
- HIV Resistentsus (P-HIV Resistentsus)
- HIV1 INI resistentsusmutatsioonid (P-HIV1 INI mut)
- HPV NAT ja vedelikupõhise tsütoloogia paneel (HPV NAT, LBC panel)
- HPV NAT paneel
- HSV1, HSV2, VZV DNA paneel
- Inimese herpeseviiruse 6 IgG, IgM (S-HHV6 IgG, S-HHV6 IgM)
- Inimese herpeseviiruse 7 IgG (S-HHV7 IgG, S-HHV7 IgM)
- Inimese herpeseviiruse 8 IgG
- Inimese herpesviiruse 6 DNA
- Inimese herpesviiruse 7 DNA
- Inimese herpesviiruse 8 DNA
- Inimese immuunpuudulikkuse viiruse 1. ja 2. tüübi antikehad, p24 antigeen (S-HIV1,2 Ag+Ab)
- Inimese immuunpuudulikkuse viiruse 1. tüübi RNA hulk (P-HIV1 RNA QN)
- Inimese immuunpuudulikkuse viiruse 2. tüübi RNA (kvalitatiivne) (P-HIV2 RNA QN)
- Inimese papilloomiviiruse DNA, kõrge riskiga genotüüp (HPV DNA genot)
- Inimese T-lümfotroopse viiruse 1. ja 2. tüübi antikehad (S-HTLV1,2 Ab)
- Jaapani entsefaliidi viiruse antikehad (S-JEV Ab)
- Leetriviiruse IgG (S-Measles IgG, S-Measles IgM)
- Lihtherpeseviiruse 1. ja 2. tüübi IgG, IgM (S-HSV1,2 IgM, S-HSV1 IgG, S-HSV2 IgG)
- Lihtherpeseviiruse 1. ja 2. tüübi IgG liikvoris (kvantitatiivne)
- Meningiiditekitajate viiruste RNA/DNA paneel liikvoris (CSF-MeningVir panel)
- Mumpsiviiruse IgG (S-Mumps IgG, S-Mumps IgM)
- Parvoviirus B19 DNA (Parvo B19 DNA)
- Parvoviirus B19 IgG (immunoblot) (S-Parvo B19 IgG IB, S-Parvo B19 IgM IB)
- Parvoviirus B19 IgG, IgM (S-Parvo B19 IgG, S-Parvo B19 IgM)
- Puukentsefaliidi viiruse IgG, IgM (S-TBEV IgG, S-TBEV IgM)
- SARS koroonaviirus 2 IgG (kvantitatiivne) (S-SARS-CoV-2 IgG QN)
- SARS koroonaviirus 2 RNA (SARS-CoV-2 RNA)
- Sooleviiruste RNA/DNA paneel (St-ParaPCR)
- Zika viiruse IgG, IgM paneel (S-Zika panel)
- Zika viiruse RNA
- Tsütomegaloviiruse DNA (kvantitatiivne) (B-CMV DNA QN)
- Tsütomegaloviiruse DNA uriinis (kvantitatiivne) (U-CMV DNA QN)
- Tsütomegaloviiruse IgG (immunoblot)
- Tsütomegaloviiruse IgG, IgM (S-CMV IgG, S-CMV IgM)
- Tsütomegaloviiruse IgG aviidsus (S-CMV IgG avd)
- Tsütomegaloviiruse IgG aviidsus (immunoblot) (S-CMV IgG avd IB)
- Tuulerõugeviiruse IgG, IgM (S-VZV IgG, S-VZV IgM)